Une Protéine Putative De Sulfolobus Acidocaldarius Apparentée Aux Protéines De La Famille "SMC" Impliquées Dans La Condensation Des Chromosomes Et À La Protéine Rad50 De Levure
Christiane ELIE, Marie-France BAUCHER, Christian FONDRAT, et Patrick FORTERRE
Institut de Génétique et Microbiologie, BMGE, Université Paris-Sud, Bat 409 91405 Orsay Cedex
Nous avons isolé un gène qui code pour une protéine putative de 103 kDa chez S. acidocaldarius. L'analyse de la séquence protéique indique un domaine central à forte
probabilité de structures "coiled-coil" et deux domaines terminaux qui possèdent des motifs
"NTPases" potentiels. Ces caractéristiques ressemblent à celles des "Mechanochemical Motor
proteins" qui utilisent l'énergie de l'hydrolyse de l'ATP pour déplacer des composants
cellulaires spécifiques. L'analyse comparée de la séquence des domaines terminaux et de
l'organisation globale de cette ATPase potentielle suggère que cette protéine est apparentée aux
protéines de la famille "SMC" impliquées dans la condensation des chromosomes et à la
protéine Rad50 de levure impliquée dans des mécanismes de réparation/recombinaison. Notre
analyse indique que toutes ces protéines sont des membres de la superfamille "VorA related"
("the VorA-related NTP-binding proteins superfamily") et forment, au sein de cette
superfamille, un sous-groupe de purine NTPases "Motor-like" eubactériennes,
archaebactériennes et eucaryotes impliquées dans des mécanismes de "DNA processing".