BLASTN 2.2.3 [May-13-2002]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= FJ0AC23ZF04FM1.SCF screened BAC_end
(1086 letters)
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
1807 sequences; 10,358,551 total letters
Searching....done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
3x_Contig1770 476 e-134
3x_Contig328 121 3e-27
>3x_Contig1770
Length = 29267
Score = 476 bits (240), Expect = e-134
Identities = 256/259 (98%), Gaps = 3/259 (1%)
Strand = Plus / Minus
Query: 87 taagctcttgatgtttggctttaatttcatgttggcagaattatcaacaaaaattgacct 146
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Sbjct: 10009 taagctcttgatgtttggctttaatttcatgttggcagaattatcaacaaaaattgacct 9950
Query: 147 taaatgggataaaatggtcgattaataggtcagcgaaccacttattgaaacgaaaagcca 206
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Sbjct: 9949 taaatgggataaaatggtcgattaataggtcagcgaaccacttattgaaacgaaaagcca 9890
Query: 207 gtaaatgagatgagtgcatgctacacattgcatataaccttgttaattcgagtgaagtgg 266
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 9889 gtaaatgagatgagtgcatgctacacattgcatataaccttgttaattcgagtgaagtgg 9830
Query: 267 ccaatctgggccatgatagtggtttatgttacatggnnattgcactgaaattacgttacc 326
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Sbjct: 9829 ccaatctgggccatgatagtggtttatgttacatgg--attgcactgaaattacgttacc 9772
Query: 327 cggtcntctggattgatcc 345
||||| |||||||||||||
Sbjct: 9771 cggtc-tctggattgatcc 9754
>3x_Contig328
Length = 2419
Score = 121 bits (61), Expect = 3e-27
Identities = 63/64 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 414 ccccccccccccccccccccccccccccccccnccccccccccccccccccccccccccc 473
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Sbjct: 45 cccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 104
Query: 474 cccc 477
||||
Sbjct: 105 cccc 108
Score = 113 bits (57), Expect = 8e-25
Identities = 68/73 (93%)
Strand = Plus / Plus
Query: 458 ccccccccccccccccccccnnncccccccccccccccccccccccccccnccccccccc 517
|||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 518 ccccccccctctc 530
|||||||||||||
Sbjct: 100 ccccccccctctc 112
Score = 113 bits (57), Expect = 8e-25
Identities = 62/64 (96%)
Strand = Plus / Plus
Query: 414 ccccccccccccccccccccccccccccccccnccccccccccccccccccccccccccc 473
|||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 474 cccc 477
||||
Sbjct: 100 cccc 103
Score = 107 bits (54), Expect = 5e-23
Identities = 68/74 (91%)
Strand = Plus / Plus
Query: 456 ccccccccccccccccccccccnnncccccccccccccccccccccccccccnccccccc 515
|||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 516 ccccccccccctct 529
||||||||| ||||
Sbjct: 100 ccccccccctctct 113
Score = 107 bits (54), Expect = 5e-23
Identities = 62/66 (93%)
Strand = Plus / Plus
Query: 442 ccccncccccccccccccccccccccccccccccccnnnccccccccccccccccccccc 501
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 502 cccccc 507
||||||
Sbjct: 100 cccccc 105
Score = 105 bits (53), Expect = 2e-22
Identities = 64/69 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 428 ccccccccccccccccccncccccccccccccccccccccccccccccccnnnccccccc 487
|||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 488 ccccccccc 496
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 105 bits (53), Expect = 2e-22
Identities = 64/69 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 434 ccccccccccccncccccccccccccccccccccccccccccccnnnccccccccccccc 493
|||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 494 ccccccccc 502
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 105 bits (53), Expect = 2e-22
Identities = 64/69 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 436 ccccccccccncccccccccccccccccccccccccccccccnnnccccccccccccccc 495
|||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 496 ccccccccc 504
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 105 bits (53), Expect = 2e-22
Identities = 64/69 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 448 ccccccccccccccccccccccccccccccnnnccccccccccccccccccccccccccc 507
|||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 508 ncccccccc 516
||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 105 bits (53), Expect = 2e-22
Identities = 64/69 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 451 cccccccccccccccccccccccccccnnncccccccccccccccccccccccccccncc 510
|||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 511 ccccccccc 519
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 105 bits (53), Expect = 2e-22
Identities = 64/69 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 450 ccccccccccccccccccccccccccccnnncccccccccccccccccccccccccccnc 509
|||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 510 ccccccccc 518
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 105 bits (53), Expect = 2e-22
Identities = 64/69 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 433 cccccccccccccncccccccccccccccccccccccccccccccnnncccccccccccc 492
|||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 493 ccccccccc 501
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 105 bits (53), Expect = 2e-22
Identities = 64/69 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 452 ccccccccccccccccccccccccccnnncccccccccccccccccccccccccccnccc 511
|||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 512 ccccccccc 520
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 105 bits (53), Expect = 2e-22
Identities = 64/69 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 427 cccccccccccccccccccncccccccccccccccccccccccccccccccnnncccccc 486
|||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 487 ccccccccc 495
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 105 bits (53), Expect = 2e-22
Identities = 64/69 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 437 cccccccccncccccccccccccccccccccccccccccccnnncccccccccccccccc 496
|||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 497 ccccccccc 505
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 105 bits (53), Expect = 2e-22
Identities = 64/69 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 419 cccccccccccccccccccccccccccncccccccccccccccccccccccccccccccn 478
|||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 479 nnccccccc 487
|||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 105 bits (53), Expect = 2e-22
Identities = 64/69 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 430 ccccccccccccccccncccccccccccccccccccccccccccccccnnnccccccccc 489
|||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 490 ccccccccc 498
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 105 bits (53), Expect = 2e-22
Identities = 64/69 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 447 cccccccccccccccccccccccccccccccnnncccccccccccccccccccccccccc 506
|||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 507 cnccccccc 515
| |||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 105 bits (53), Expect = 2e-22
Identities = 64/69 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 449 cccccccccccccccccccccccccccccnnncccccccccccccccccccccccccccn 508
|||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 509 ccccccccc 517
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 105 bits (53), Expect = 2e-22
Identities = 64/69 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 438 ccccccccncccccccccccccccccccccccccccccccnnnccccccccccccccccc 497
|||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 498 ccccccccc 506
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 105 bits (53), Expect = 2e-22
Identities = 64/69 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 453 cccccccccccccccccccccccccnnncccccccccccccccccccccccccccncccc 512
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 513 ccccccccc 521
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 105 bits (53), Expect = 2e-22
Identities = 64/69 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 454 ccccccccccccccccccccccccnnncccccccccccccccccccccccccccnccccc 513
|||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 514 ccccccccc 522
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 105 bits (53), Expect = 2e-22
Identities = 64/69 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 431 cccccccccccccccncccccccccccccccccccccccccccccccnnncccccccccc 490
|||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 491 ccccccccc 499
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 105 bits (53), Expect = 2e-22
Identities = 64/69 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 429 cccccccccccccccccncccccccccccccccccccccccccccccccnnncccccccc 488
|||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 489 ccccccccc 497
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 105 bits (53), Expect = 2e-22
Identities = 64/69 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 426 ccccccccccccccccccccncccccccccccccccccccccccccccccccnnnccccc 485
|||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 486 ccccccccc 494
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 105 bits (53), Expect = 2e-22
Identities = 64/69 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 425 cccccccccccccccccccccncccccccccccccccccccccccccccccccnnncccc 484
|||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 485 ccccccccc 493
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Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 105 bits (53), Expect = 2e-22
Identities = 64/69 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 421 cccccccccccccccccccccccccncccccccccccccccccccccccccccccccnnn 480
|||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 481 ccccccccc 489
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 105 bits (53), Expect = 2e-22
Identities = 64/69 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 424 ccccccccccccccccccccccncccccccccccccccccccccccccccccccnnnccc 483
|||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 484 ccccccccc 492
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 105 bits (53), Expect = 2e-22
Identities = 64/69 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 422 ccccccccccccccccccccccccncccccccccccccccccccccccccccccccnnnc 481
|||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 482 ccccccccc 490
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 105 bits (53), Expect = 2e-22
Identities = 64/69 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 435 cccccccccccncccccccccccccccccccccccccccccccnnncccccccccccccc 494
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Query: 495 ccccccccc 503
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Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 105 bits (53), Expect = 2e-22
Identities = 64/69 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 432 ccccccccccccccncccccccccccccccccccccccccccccccnnnccccccccccc 491
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Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 492 ccccccccc 500
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Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 105 bits (53), Expect = 2e-22
Identities = 64/69 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 420 ccccccccccccccccccccccccccncccccccccccccccccccccccccccccccnn 479
|||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 480 ncccccccc 488
||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 105 bits (53), Expect = 2e-22
Identities = 64/69 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 439 cccccccncccccccccccccccccccccccccccccccnnncccccccccccccccccc 498
|||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 499 ccccccccc 507
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 105 bits (53), Expect = 2e-22
Identities = 64/69 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 423 cccccccccccccccccccccccncccccccccccccccccccccccccccccccnnncc 482
|||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 483 ccccccccc 491
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
Posted date: Nov 27, 2002 12:23 PM
Number of letters in database: 10,358,551
Number of sequences in database: 1807
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 17,789
Number of Sequences: 1807
Number of extensions: 17789
Number of successful extensions: 4548
Number of sequences better than 1.0e-20: 2
length of query: 1086
length of database: 10,358,551
effective HSP length: 16
effective length of query: 1070
effective length of database: 10,329,639
effective search space: 11052713730
effective search space used: 11052713730
T: 0
A: 40
X1: 6 (11.9 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 51 (101.6 bits)