BLASTN 2.2.3 [May-13-2002]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= FJ0AC24ZC07RM1.SCF screened BAC_end
(882 letters)
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
1807 sequences; 10,358,551 total letters
Searching....done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
3x_Contig1591 547 e-155
3x_Contig328 127 4e-29
3x_Contig142 101 2e-21
>3x_Contig1591
Length = 14045
Score = 547 bits (276), Expect = e-155
Identities = 276/276 (100%)
Strand = Plus / Minus
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 10593 cagaagacctgccagaaaacttcggattgatattttttttctagtactctggcacggtgc 10534
Query: 110 aaagcacatgctggatctgccaaatcttactgttatgtatcatatagagagagtattttg 169
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 10533 aaagcacatgctggatctgccaaatcttactgttatgtatcatatagagagagtattttg 10474
Query: 170 tattctaaaacttttggatagtttcgtagaaagtcttaccttggatttcgtgaaccttca 229
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 10473 tattctaaaacttttggatagtttcgtagaaagtcttaccttggatttcgtgaaccttca 10414
Query: 230 attccaagtcagatggtgttctggaaccatctgcaccggcaatggtaccagcaccccatg 289
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 10413 attccaagtcagatggtgttctggaaccatctgcaccggcaatggtaccagcaccccatg 10354
Query: 290 gagaaccaccatgagcttcgtctaagtttgtcaatt 325
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 10353 gagaaccaccatgagcttcgtctaagtttgtcaatt 10318
>3x_Contig328
Length = 2419
Score = 127 bits (64), Expect = 4e-29
Identities = 69/71 (97%)
Strand = Plus / Plus
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|||||||||||
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Score = 125 bits (63), Expect = 2e-28
Identities = 67/69 (97%)
Strand = Plus / Plus
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|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 684 ccccccccc 692
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 125 bits (63), Expect = 2e-28
Identities = 67/69 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 433 ccccnccccccccccccccccccccccccncccccccccccccccccccccccccccccc 492
|||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 493 ccccccccc 501
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 125 bits (63), Expect = 2e-28
Identities = 67/69 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 458 ccccnccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccncccc 517
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
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Query: 518 ccccccccc 526
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 123 bits (62), Expect = 6e-28
Identities = 67/69 (97%)
Strand = Plus / Plus
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Query: 569 ccccccccc 577
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 123 bits (62), Expect = 6e-28
Identities = 67/69 (97%)
Strand = Plus / Plus
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Query: 523 ccccccccc 531
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 123 bits (62), Expect = 6e-28
Identities = 67/69 (97%)
Strand = Plus / Plus
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Query: 526 ccccccccc 534
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 123 bits (62), Expect = 6e-28
Identities = 67/69 (97%)
Strand = Plus / Plus
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Query: 524 ccccccccc 532
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Identities = 67/69 (97%)
Strand = Plus / Plus
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Strand = Plus / Plus
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Strand = Plus / Plus
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Query: 540 ccccccccc 548
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Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 123 bits (62), Expect = 6e-28
Identities = 67/69 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 443 cccccccccccccccccccncccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 502
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Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 503 ccccccccc 511
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Sbjct: 100 ccccccccc 108
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Identities = 67/69 (97%)
Strand = Plus / Plus
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Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 535 ccccccccc 543
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Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 123 bits (62), Expect = 6e-28
Identities = 67/69 (97%)
Strand = Plus / Plus
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Query: 530 ccccccccc 538
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Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 123 bits (62), Expect = 6e-28
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Strand = Plus / Plus
Query: 476 cccccccccccccccccccccccccccccccccccccncccccccccccccccccccccc 535
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Query: 536 ccccccccc 544
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Sbjct: 100 ccccccccc 108
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Identities = 67/69 (97%)
Strand = Plus / Plus
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Query: 500 ccccccccc 508
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
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Strand = Plus / Plus
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Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 528 ccccccccc 536
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 123 bits (62), Expect = 6e-28
Identities = 67/69 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 441 cccccccccccccccccccccncccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 500
|||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 501 ccccccccc 509
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 123 bits (62), Expect = 6e-28
Identities = 67/69 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 479 ccccccccccccccccccccccccccccccccccnccccccccccccccccccccccccc 538
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 539 ccccccccc 547
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 123 bits (62), Expect = 6e-28
Identities = 67/69 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 467 ccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccnccccccccccccc 526
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 527 ccccccccc 535
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Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 123 bits (62), Expect = 6e-28
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Strand = Plus / Plus
Query: 473 ccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccnccccccccccccccccccc 532
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 533 ccccccccc 541
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Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 123 bits (62), Expect = 6e-28
Identities = 67/69 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 481 ccccccccccccccccccccccccccccccccnccccccccccccccccccccccccccc 540
|||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 541 ccccccccc 549
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Score = 123 bits (62), Expect = 6e-28
Identities = 67/69 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 439 cccccccccccccccccccccccncccccccccccccccccccccccccccccccccccc 498
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Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 499 ccccccccc 507
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 123 bits (62), Expect = 6e-28
Identities = 67/69 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 474 cccccccccccccccccccccccccccccccccccccccncccccccccccccccccccc 533
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Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 534 ccccccccc 542
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Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 123 bits (62), Expect = 6e-28
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Strand = Plus / Plus
Query: 477 ccccccccccccccccccccccccccccccccccccnccccccccccccccccccccccc 536
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Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 537 ccccccccc 545
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 123 bits (62), Expect = 6e-28
Identities = 67/69 (97%)
Strand = Plus / Plus
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Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 538 ccccccccc 546
|||||||||
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Score = 123 bits (62), Expect = 6e-28
Identities = 67/69 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 472 cccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccncccccccccccccccccc 531
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 532 ccccccccc 540
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 123 bits (62), Expect = 6e-28
Identities = 67/69 (97%)
Strand = Plus / Plus
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|||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 504 ccccccccc 512
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 123 bits (62), Expect = 6e-28
Identities = 67/69 (97%)
Strand = Plus / Plus
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|||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 498 ccccccccc 506
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 123 bits (62), Expect = 6e-28
Identities = 67/69 (97%)
Strand = Plus / Plus
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|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
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Identities = 67/69 (97%)
Strand = Plus / Plus
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|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 531 ccccccccc 539
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Strand = Plus / Plus
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Query: 690 cccc 693
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Identities = 63/64 (98%)
Strand = Plus / Plus
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 45 cccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 104
Query: 575 cccc 578
||||
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Strand = Plus / Plus
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Identities = 66/69 (95%)
Strand = Plus / Plus
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Score = 117 bits (59), Expect = 4e-26
Identities = 66/69 (95%)
Strand = Plus / Plus
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|||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
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Query: 680 ccccccccc 688
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 117 bits (59), Expect = 4e-26
Identities = 66/69 (95%)
Strand = Plus / Plus
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|||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
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Query: 681 ccccccccc 689
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Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 117 bits (59), Expect = 4e-26
Identities = 66/69 (95%)
Strand = Plus / Plus
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|||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Sbjct: 100 ccccccccc 108
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Identities = 66/69 (95%)
Strand = Plus / Plus
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|||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 509 ccccncccc 517
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Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 117 bits (59), Expect = 4e-26
Identities = 66/69 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 450 ccccccccccccnccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 509
|||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 510 cccnccccc 518
||| |||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 117 bits (59), Expect = 4e-26
Identities = 66/69 (95%)
Strand = Plus / Plus
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|||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 678 ccccccccc 686
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
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Identities = 66/69 (95%)
Strand = Plus / Plus
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|||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 515 ccccccccc 523
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
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Identities = 66/69 (95%)
Strand = Plus / Plus
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|||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 514 ccccccccc 522
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 117 bits (59), Expect = 4e-26
Identities = 66/69 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 619 cccccccccncccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccncccccccc 678
|||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 679 ccccccccc 687
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 117 bits (59), Expect = 4e-26
Identities = 66/69 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 452 ccccccccccnccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 511
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 512 cnccccccc 520
| |||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 115 bits (58), Expect = 2e-25
Identities = 66/69 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 497 ccccccccccccccccnccccccccccccccccccccccccccccccccccccctccccc 556
|||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
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|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 115 bits (58), Expect = 2e-25
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Strand = Plus / Plus
Query: 506 cccccccnccccccccccccccccccccccccccccccccccccctcccccccccccccc 565
|||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 566 ccccccccc 574
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 115 bits (58), Expect = 2e-25
Identities = 66/69 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 490 cccccccccccccccccccccccncccccccccccccccccccccccccccccccccccc 549
|||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 550 ctccccccc 558
| |||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 115 bits (58), Expect = 2e-25
Identities = 66/69 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 502 cccccccccccnccccccccccccccccccccccccccccccccccccctcccccccccc 561
|||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 562 ccccccccc 570
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 115 bits (58), Expect = 2e-25
Identities = 66/69 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 492 cccccccccccccccccccccnccccccccccccccccccccccccccccccccccccct 551
|||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 552 ccccccccc 560
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 115 bits (58), Expect = 2e-25
Identities = 66/69 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 496 cccccccccccccccccnccccccccccccccccccccccccccccccccccccctcccc 555
|||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 556 ccccccccc 564
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 115 bits (58), Expect = 2e-25
Identities = 66/69 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 495 ccccccccccccccccccnccccccccccccccccccccccccccccccccccccctccc 554
|||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 555 ccccccccc 563
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 115 bits (58), Expect = 2e-25
Identities = 66/69 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 500 cccccccccccccnccccccccccccccccccccccccccccccccccccctcccccccc 559
|||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 560 ccccccccc 568
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 115 bits (58), Expect = 2e-25
Identities = 66/69 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 494 cccccccccccccccccccnccccccccccccccccccccccccccccccccccccctcc 553
|||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 554 ccccccccc 562
|||||||||
Sbjct: 100 ccccccccc 108
Score = 115 bits (58), Expect = 2e-25
Identities = 66/69 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 489 ccccccccccccccccccccccccnccccccccccccccccccccccccccccccccccc 548
|||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 40 cccctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 99
Query: 549 cctcccccc 557
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