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International Summer School |
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From Genome to Life:Structural, Functional and Evolutionary approaches |
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MONDAY, JULY
15
TUESDAY, JULY
16
Morning
9 :00
M.
Duguet
School opening
9 :30
E.
Trifonov
Early evolution: from
first codons to first proteins.
10 :30
S.
Brenner
Genome annotation
challenge
11 :30
Break
11 :45
G.
Fichant
Identification, assembly,
classification of integrated biological systems in
completely sequenced genomes : examples of ABC
transporters
12 :30
Lunch
Afternoon
14 :30
E. Trifonov,
S. Brenner
Round Table and short
contributions on genome annotation
17 :00
Beach
WEDNESDAY, JULY
17
Morning
9 :00
O.
Gascuel
Phylogeny reconstruction
methods: basic principles and
comparisons
9 :45
P.
Forterre
Origin and evolution of
DNA and DNA replication mechanisms : the viral
connection
10 :30
Break
10 :45
A.
Goffeau
Phylogenetic
classification - Yeast - Membrane proteins -
Transporters
11 :30
B.
Labedan
A genomic approach of
molecular evolution
12 :30
Lunch
Afternoon
14 :00
P. Forterre,
B. Labedan
Round table :
phylogeny + short contributions
16 :30
Beach
THURSDAY , JULY
18
Morning
9 :00
E.
Koonin
Evolutionary inferences
from whole-genome comparisons
10 :00
H. Ogata
Comparative genome
analysis: example of Rickettsia
11 :00
Break
11 :15
W.
Baumeister
Electron tomography:
towards visualizing supramolecular architecture
inside cells
12 :15
Lunch
Afternoon
14 :00
M.
Marilley
Contributions of molecular
modelling and atomic force microscopy to genome
study
15:00
E.
Koonin
Round table and short
contributions
17 :00
Beach
FRIDAY, JULY
19
Morning
9 :00
O.
Grenet
Application of genomics to
drug development
10 :15
A. Fagot-Largeault
Diagnostic
génétique, thérapie
génique, thérapie cellulaire :
problèmes éthiques
11 :00
A. Fagot-Largeault,
J.P. Amman
Round table and short
contributions: bioethical problems
12
:30
Lunch
Afternoon
14 :00
Boat or bus
trip
SATURDAY, JULY
20
Morning
9:00
H. Van
Tilbeurgh
Structural
genomics
9:45
D. Moras
Structural genomics of
orphan nuclear receptors
10:30
Break
10:45
H. Van Tilbeurgh,
W Baumeister, Round Table : structural
Genomics : X-ray, EM, AFM ...
12:30
Lunch
Afternoon
14:00
S.
Brenner
Structural Genomics of
proteins and RNA
15:00
S.
Brenner
Short
contributions
17:00
Beach
SUNDAY, JULY
21
FREE
MONDAY, JULY
22
Morning
9 :00
JF.
Allen
Hypothetico-deductive
science and the function of cytoplasmic
genomes
10:00
P. Avner
A functional genomics
approach to X-inactivation
11:00
Break
11 :15
E.
Westhof
Structural bioinformatics
of structured RNAs
12 :15
Lunch
Afternoon
14 :00
D.
Gautheret
RNA bioinformatics:
identification of non coding RNA in genomic
sequences
15 :00
P. Avner
Short
contributions
17:00
Beach
TUESDAY, JULY
23
Morning
9 :00
S.
Oliver
Functional
genomics
10 :00
M. Bolotin-Fukuhara
Regulation networks in
yeast ?
11 :00
Break
11 :15
M.
Dutreix
Cellular consequences of
growth in continuous exposure to low doses of
ionizing radiations: detection of epigenetic
changes using DNA microarrays
12 :15
Lunch
Afternoon
14 :00
D.
Thieffry
Computational integration,
analysis, and simulation of genetic regulatory
networks
14 :45
M. Bolotin-Fukuhara,
M. Dutreix
Round Table and short
contributions : Transcriptome
17 :00
Beach
WEDNESDAY, JULY
24
Morning
9 :00
T.
Rabilloud
Proteomics
overview
9 :45
P.
Legrain
In depth analyses of
protein networks lead to the discovery of protein
function
10 :30
Break
10 :45
B.
Seraphin
Proteome analysis and
functional characterisation of protein complexes
using the TAP method (Tandem Affinity
Purification).
11 :30
M.
Werner
Post-genomic study of the
integration of transcription with other aspects of
the nuclear metabolism and of the proteomic
adaptation in response to cadmium in
yeast.
12 :15
Lunch
Afternoon
14 :00
P. Legrain,
T. Rabilloud
Round Table and short
contributions on proteomics
16:00
H.
Roest-Croilus
Tetraodon
annotation
17 :00
Beach
THURSDAY, JULY
25
Morning
9 :00
T. Sijen
The mechanism of RNA
interference and the transposon silencing in
caenorhabditis elegans
9 :45
K. Van de
Sande
GARNet, the Genomic
Arabidopsis Resource Network
10 :30
Break
10 :45
K. Van de
Sande
Short contributions on
Arabidopsis
11 :30
W. Hol
Medicinal protein
crystallography and structural genomics for
tropical diseases
12 :15
Lunch
Afternoon
14 :00
G.
Weinstock
Genomics and bacterial
pathogenesis
15 :00
W. Hol, P. Legrain, JP.
Amann
Round Table :
Applications to pharmacology / Industrial projects
and ethics
17 :00
Beach
FRIDAY, JULY
26
Morning
9 :00
A.
Munnich
From disease genes to
prevention and treatment
9:45
M.
Fellous
Y Chromosome, human
populations and sex
10 :30
Break
10:45
Short
contributions
12 :15
Lunch
Afternoon
14 :00
J.
Demaille
CONCLUSIONS : Genomics,
from fondamental research to public
health?
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