Patrick Forterre Sommaire

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Activités de recherche, présentation détaillée

• Avant propos

• 1) Etudes sur la réplication de l'ADN in vitro chez E. coli

  • Mise en évidence de deux étapes dans l'élongation de la réplication chez E. coli.
  • Modèle d'action à deux cassures pour l'ADN gyrase
  • Stimulation de la réplication d'un plasmide contenant oriC (minichromosome) par la méthylation de type dam.
  • Répartition restreinte de la méthylation de type dam chez les procaryotes

• 2) Etudes de la réplication chez les archaebactéries

  • Inhibition de la réplication de l'ADN par l'aphidicoline chez les archaebactéries halophiles.
  • Isolement des ADN polymérases des archaebactéries thermophiles extrêmes.
  • Variation de la sensibilité à l'aphidicoline chez les ADN polymérases de la famille B.
  • Nouvelles ADN polymérases hyperthermophiles pour la PCR.
  • Identification d'un plasmide d'archaebactérie hyperthermophile se répliquant par le mécanisme du cercle roulant.
  • Un nouveau type de protéine Rep plasmidique

• 3) Etudes des ADN topoisomérases et de la topologie de l'ADN chez les archaebactéries

  • Découverte de la reverse gyrase
  • Mise en évidence du surenroulement positif in vivo.
  • La reverse gyrase, une enzyme signature des hyperthermophiles.
  • Un nouveau modèle enzymatique : l'association hélicase-topoisomérase.
  • Mise en évidence de plasmides relâchés et surenroulés positivement chez les archaebactéries hyperthermophiles.
  • Modification de la topologie au cours de chocs thermiques
  • Modèle homéostatique pour expliquer l'effet de la température sur le nombre d'entrelacements.
  • La reverse gyrase inhibe la transcription in vitro.
  • L'ADN topologiquement fermé est stable au moins jusqu'à 110*C.
  • Les sels protègent l'ADN contre la dégradation thermique
  • Les archaebactéries halophiles sont sensibles aux inhibiteurs des ADN topoisomérases de type II classiques.
  • Découverte d'une nouvelle famille d'ADN topoisomérase de type II.
  • L'étude de la Topo VI nous a déjà conduits à faire deux observations importantes. Découverte d'un nouveau module ATP
  • Identification de la protéine qui initie la recombinaison méiotique en cassant les chromosomes.
  • L'ADN des eubactéries hyperthermophiles est surenroulé négativement !

• 4) Etudes sur l'évolution des protéines et des microorganismes.

  • Evolution des protéines et phylogénie moléculaire : mise en évidence de deux familles paralogues chez les glutamate dehydrogénases.
  • Le premier âge du monde à ADN
  • La racine de l'arbre universel en question.
  • L'application de la cladistique (selon Hennig) à la phylogénie moléculaire.
  • Les procaryotes ne sont pas si pro que cela !
  • De la difficulté d'établir un lien direct entre une origine de la vie à haute température et l'apparition des hyperthermophiles.
  • L'origine des procaryotes par thermoréduction ?
  • L'ARN messager, talon d'achille des hyperthermophiles
  • LUCA était un organisme complexe qui a pu donner naissance à la fois aux procaryotes et aux eucaryotes
  • Les Virus, témoins de l'ère pré-LUCA ?

• 5) Projets et perspectives

  • Topologie de l'ADN et ADN topoisomérases
    Etude de la Topo VI
  • Etude de la gyrase de l'ADN topoisomérase II de T. maritima.
  • Topologie de l'ADN chez les hyperthermophiles.
  • Réparation, recombinaison et réplication de l'ADN
  • Réplication de l'ADN
  • Génomique et post-génomique chez les archaebactéries.
  • Mise au point d'outils génétiques

• Travaux personnels sur l'évolution des microorganismes

Liens vers d'autres pages de ce serveur dont je suis l'auteur:

 Mon CV se trouve ici. (En Anglais!)

Vous pouvez lire un résumé de l'exposé que j'ai fait pendant le 11^ème "International Conference on the Origine of Life", juin 7-12, 1996 Orléans, France

Un autre résumé d'une conférence donnée penadant le "First Internationnal Congress on Hyperthermophiles ", à Estoril les 2-6 Juin 96, Portugal.

Un article: Les Origines de la vie, Nouveaux Concepts, Nouvelles Questions qui donne mon point de vue sur le problème du dernier ancêtre commun et des origines de la vie.

 Synthèse d'un Colloque de La Fondations des Treilles que j'ai organisé, qui c'est tenu aux Treilles (France), du 18 au 24 juillet 1996 : LUCA, à la recherche du dernier ancêtre commun.

Révision le 24/02/97

forterre@igmors.u-psud.fr